Система защитных мероприятий в первую очередь должна быть направлена на профилактику заболеваний и снижение численности возбудителей болезней и вредителей. Особое внимание следует уделять применению агротехнических, биологических, организационно-хозяйственных, селекционно-семеноводческих, физических и других методов с целью сокращения объёмов применения пестицидов для обработки посевов в период вегетации картофеля. Меры борьбы с болезнями и вредителями должны быть направлены на подавление их комплексов в наиболее уязвимых фазах развития.
Степень и характер вреда, причиняемого картофелю, зависят от многих причин: природных условий зоны возделывания, фитосанитарной обстановки на поле, уровня агротехники, качества семенного материала, устойчивости возделываемых сортов к болезням и вредителям, и других факторов.
Мероприятия, направленные на борьбу с болезнями, вредителями и сорняками должны быть спланированы так, чтобы войти во все элементы технологического процесса возделывания картофеля. Следует учитывать, что защитные мероприятия в крупных растениеводческих хозяйствах, крестьянско-фермерских хозяйствах и в ЛПХ имеют свои особенности.
Для выбора оптимальных вариантов защиты картофеля можно пользоваться специальными диалоговыми компьютерными программами, разработанными для этих целей во ВНИИ Картофельного Хозяйства и ВНИИ Фитопатологии.
Профилактические мероприятия направлены на предупреждение, подавление или уничтожение первичной инфекции, от которой начинается развитие болезней. Наиболее важными из них являются: предпосадочная отбраковка зараженных клубней, уничтожение куч и мест свалок больного картофеля, предпосадочная подготовка семенных клубней, включающая озеленение, проращивание, обработку микроэлементами и фунгицидами, обеззараживание машин для перевозки картофеля и мест его хранения.